Sở Y tế là cơ quan chuyên môn thuộc UBND tỉnh Phú Thọ. Chức năng, nhiệm vụ và quyền hạn của Sở Y tế tỉnh Phú Thọ được quy định tại Quyết định số 6/2025-QĐ-UBND của UBND tỉnh, ngày 01/7/2025, cụ thể như sau:
Sở Y tế Phú Thọ (trước đây là Ty Y tế Phú Thọ), được thành lập năm 1945 với cơ sở ban đầu là Ban hành chính Ty gồm 01 y sỹ, một số y tá và cán bộ hành chính, 1 bệnh viện với 50 giường bệnh.